紐約市下水道，四只小海龜和一只小老鼠由于接觸了含有放射性物質的凝膠而變異為巨大的人化生物。 暴躁沖動卻富有激情的拉斐爾，幽默風趣的的米開朗基羅，個性沉穩的多納泰羅以及他們的領導者達芬奇，這四只功夫高強的忍者龜便肩負起為紐約市除暴安良..